林业科学研究

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氮和生物炭添加对毛竹林AMF侵染率和孢子密度的影响

史雪荣, 黄宏亮, 季杭翔, 赵明水, 张华锋, 李全, 宋新章

2023, 36(4): 165-172. doi: 10.12403/j.1001-1498.20220448

关键词: 毛竹, 氮沉降, 生物炭, 丛枝菌根真菌, 侵染率

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长白山区次生阔叶林采伐林隙更新研究

宋新章, 李冬生, 肖文发, 李秀英

2007, 20(3): 302-306.

关键词: 次生阔叶林, 采伐林隙, 更新, 长白山

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长白山次生杨桦林采伐林隙乔灌木幼苗更新比较研究

宋新章, 张智婷, 肖文发, 黄志霖, 刘晓昕

2008, 21(3): 289-294.

关键词: 采伐林隙, 更新, 次生林, 长白山

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毛竹硝态氮转运蛋白家族PeNPFs基因鉴定及其表达特性分析

袁婷婷, 朱成磊, 杨克彬, 宋新章, 高志民

2021, 34(3): 1-12. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.03.001

关键词: 毛竹, 硝态氮转运蛋白基因, 分子特征, 表达模式

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目的鉴定毛竹中硝态氮转运蛋白(NPF)家族基因成员，系统分析其分子特征和表达模式，为深入研究毛竹NPF基因的硝态氮转运功能奠定基础。方法采用生物信息学方法从毛竹基因组中鉴定NPF家族基因成员，并对其启动子调控元件、基因结构、编码蛋白理化性质、保守结构域、系统进化等进行全面分析，利用已有转录组数据，对毛竹NPF基因的组织表达特异性以及不同非生物胁迫和激素处理后的表达模式进行分析。结果在毛竹中共鉴定NPF家族成员基因27个，其基因结构差别较大，内含子数量为2～5个，编码区最长为2286 bp (PeNPF7.4)，最短为1359 bp (PeNPF8.8)。基因启动子调控元件分析发现，PeNPFs启动子序列中包含多种与低温和干旱等非生物胁迫以及GA₃和NAA等激素响应相关的元件。PeNPFs编码蛋白的分子量介于49.56～82.08 kDa之间，理论等电点为5.17～9.85，大部分是中性或碱性蛋白，均含有类似的跨膜结构；系统进化分析表明，毛竹27个PeNPFs分属于7个亚家族，各亚家族成员数量分别为1、3、1、6、1、7和8个；蛋白保守基序分析显示，PeNPFs共有10个保守基序，其中motif 1、motif 2和motif 4是各成员共有的高度保守的基序。基于转录组数据的表达谱热图分析显示，PeNPFs在叶片、花序、根、鞭和笋等不同组织中的表达存在一定差异，但各成员至少在1个组织中检测到表达，部分成员的表达表现为组织特异性或组成型表达。在冷和干旱处理后，PeNPF5.3、PeNPF7.2、PeNPF7.3和PeNPF8.7的表达量均显著下调，这与其启动子序列中存在与低温和干旱响应调控元件相一致；在GA₃和NAA处理后，PeNPF7.3和PeNPF7.6呈相反的表达变化，而PeNPF7.1的表达趋势相似。结论毛竹中有27个NPFs家族基因成员，分为7个亚家族，各亚家族成员之间的分子特征和组织表达特异性均存在一定的差异，且一些基因对非生物胁迫和激素处理的响应变化均达到显著性差异，推测这些基因在毛竹不同组织中及应对不同环境过程中对硝态氮的转运可能发挥着不同的功能，研究结果为揭示PeNPFs的生物学功能提供了重要依据。

毛竹NLP转录因子鉴定及其响应氮素的表达模式

袁婷婷, 朱成磊, 李紫阳, 宋新章, 高志民

2021, 34(5): 39-48. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.005.005

关键词: 毛竹, NLP转录因子, 家族鉴定, 氮素响应

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